C'est Zetsu qui l'introduit après la mort de Sasori, mais il ne faisait pas partie d'Akatsuki à cette époque. Dans le chapitre 317, on le voit avec l'uniforme d'Akatsuki aux côtés de Deidara. Ils combattent ensemble un monstre gigantesque à trois queues ressemblant à une tortue. Durant le combat, il montre une certaine peur à l'idée d'affronter un tel monstre seul. Néanmoins son camarade va quand même l'aider (bien qu'il ait déjà rempli son quota de Jinchuuruki capturé).
Certains fans pensent que Tobi serait Obito Uchiwa, feu le camarade de Kakashi. La correspondance entre les deux prénoms, le fait qu'il soit mort prés du pays de l'herbe (le pays de son "camarade" de l'Akatsuki Zetsu), le fait que le masque de Tobi ne revèle que l'œil droit (qui est également le seul œil intact d'Obito) et les paroles d'Itachi qui suggère l'existence d'un troisième Uchiwa vivant concorderait à ce qui n'est néanmoins qu'une rumeur.